張伯端的思想可大致劃為三個時期，大約可以以他的三本著作為界：
1、《悟真篇》代表早期的出儒入道，倡道教內丹為中心的三教合一思想；
2、《禪宗詩偈》（即《悟真篇后遺》）代表中期思想，出道入禪，以徹了禪宗性學為歸宿；
3、《玉清金笥青華秘文金寶內煉丹訣》代表晚期的轉變，禪道雙融，而正式釀成一種獨具特色的內丹學說。
張伯端的內丹學說主張以內丹為修仙途徑，而以“性命雙修”為其內煉大旨。認為以人體為鼎爐，以精氣為藥物，以神為火候，通過內煉，使精氣凝聚不散，結成金丹。同時，他繼承陳摶內丹修煉的系統方法，將煉養分成四個階段進行，即：筑基、煉精化氣、煉氣化神、煉神還虛。
張伯端雖然認為道、儒、釋 “教雖分三，道乃歸一”，但與全真不同，他主張先修命、后修性，尤其推崇佛教禪宗“明性”境界。《佛祖統記》說他“嘗遍參禪門，大有省發”，他自己亦聲稱“仆得達磨、六祖最上一乘之妙旨，可因一言而悟萬法”。
張伯端認為：“老氏以煉養為真，若得其要樞，則立躋圣位；如其未明本性，則猶滯于幻形”。因此，他將道教煉形氣作為修命，以禪宗“明心見性”、“頓悟圓通”釋內丹「煉神返虛」之境為修性，主張：“先以神仙命脈誘其修煉，次以諸佛妙用廣其神通，終以真如覺性遣其幻妄，而歸于究竟空寂之本源”。
在修行上，張伯端反對形式上的出家離俗，隱避山林。而主張“大隱隱于市”，他似乎也無意建立教團。他本人就不是出家的道士。南宗直至五祖白玉蟾，始開始有云游道士，也組織了南宗自己的教團組織。
著作有《悟真篇》、《金丹四百字》、《禪宗詩偈》三十二首。晚年其弟子王叔邦輯有《玉清金笥青華秘文金寶內煉丹訣》，簡稱《青華秘文》。
其中，于北宋熙寧八年（公元 1075年）撰寫的《悟真篇》，以《陰符經》《道德經》為兩大理論依據，“略仿《參同契》”（清.朱元育的《悟真篇闡幽》），全書宗承傳統內丹學說，說明內丹煉養的根本原理就是歸根返本，逆煉歸元，并描繪內丹修煉的全過程及闡發丹經要點、修煉內丹的方法。《四庫全書總目提要》謂：“是書專明金丹之要，與魏伯陽《參同契》，道家并推為正宗”。《道臧精華錄》謂：“是書辭旨暢達，義理淵深，乃修丹之金科，為養生之玉律”。
該書是最重要的煉丹理論及實踐著作著作之一。與之前的道教經典《周易參同契》齊名。全書由詩 詞歌曲等體裁寫成。其中七言律詩一十六首，七言絕句六十四首，五言四韻一首；《西江月》詞十二首（又一首）、和七言絕句五首，以及歌頌詩曲雜言三十多首。有前、后二序。歷代都有大量的注疏本，仁智自見。
1、《悟真篇》代表早期的出儒入道，倡道教內丹為中心的三教合一思想；
2、《禪宗詩偈》（即《悟真篇后遺》）代表中期思想，出道入禪，以徹了禪宗性學為歸宿；
3、《玉清金笥青華秘文金寶內煉丹訣》代表晚期的轉變，禪道雙融，而正式釀成一種獨具特色的內丹學說。
張伯端的內丹學說主張以內丹為修仙途徑，而以“性命雙修”為其內煉大旨。認為以人體為鼎爐，以精氣為藥物，以神為火候，通過內煉，使精氣凝聚不散，結成金丹。同時，他繼承陳摶內丹修煉的系統方法，將煉養分成四個階段進行，即：筑基、煉精化氣、煉氣化神、煉神還虛。
張伯端雖然認為道、儒、釋 “教雖分三，道乃歸一”，但與全真不同，他主張先修命、后修性，尤其推崇佛教禪宗“明性”境界。《佛祖統記》說他“嘗遍參禪門，大有省發”，他自己亦聲稱“仆得達磨、六祖最上一乘之妙旨，可因一言而悟萬法”。
張伯端認為：“老氏以煉養為真，若得其要樞，則立躋圣位；如其未明本性，則猶滯于幻形”。因此，他將道教煉形氣作為修命，以禪宗“明心見性”、“頓悟圓通”釋內丹「煉神返虛」之境為修性，主張：“先以神仙命脈誘其修煉，次以諸佛妙用廣其神通，終以真如覺性遣其幻妄，而歸于究竟空寂之本源”。
在修行上，張伯端反對形式上的出家離俗，隱避山林。而主張“大隱隱于市”，他似乎也無意建立教團。他本人就不是出家的道士。南宗直至五祖白玉蟾，始開始有云游道士，也組織了南宗自己的教團組織。
著作有《悟真篇》、《金丹四百字》、《禪宗詩偈》三十二首。晚年其弟子王叔邦輯有《玉清金笥青華秘文金寶內煉丹訣》，簡稱《青華秘文》。
其中，于北宋熙寧八年（公元 1075年）撰寫的《悟真篇》，以《陰符經》《道德經》為兩大理論依據，“略仿《參同契》”（清.朱元育的《悟真篇闡幽》），全書宗承傳統內丹學說，說明內丹煉養的根本原理就是歸根返本，逆煉歸元，并描繪內丹修煉的全過程及闡發丹經要點、修煉內丹的方法。《四庫全書總目提要》謂：“是書專明金丹之要，與魏伯陽《參同契》，道家并推為正宗”。《道臧精華錄》謂：“是書辭旨暢達，義理淵深，乃修丹之金科，為養生之玉律”。
該書是最重要的煉丹理論及實踐著作著作之一。與之前的道教經典《周易參同契》齊名。全書由詩 詞歌曲等體裁寫成。其中七言律詩一十六首，七言絕句六十四首，五言四韻一首；《西江月》詞十二首（又一首）、和七言絕句五首，以及歌頌詩曲雜言三十多首。有前、后二序。歷代都有大量的注疏本，仁智自見。
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